Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ZBED3Q96IU2 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
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ZBED3Q96IU2 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
ZBED3Q96IU2 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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