Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CCDC47Q96A33 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
CCDC47Q96A33 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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