Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
SSX1Q16384 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
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