Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
NEDD8Q15843 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
NEDD8Q15843 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms