Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.397-201ENST00000383950 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC00354-202ENST00000440860 376 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
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