Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.570-201ENST00000384750 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PUM3Q15397 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PUM3Q15397 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms