Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
NKX1-1Q15270 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NKX1-1Q15270 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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