Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.59
SHPRHQ149N8 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
SHPRHQ149N8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
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