Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ALCAMQ13740 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ALCAMQ13740 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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