Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SNX1Q13596 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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SNX1Q13596 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SNX1Q13596 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SNX1Q13596 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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SNX1Q13596 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SNX1Q13596 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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SNX1Q13596 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
SNX1Q13596 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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