Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PRPF4BQ13523 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PRPF4BQ13523 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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