Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.26□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
XRCC4Q13426 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
XRCC4Q13426 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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