Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-803P-201ENST00000516034 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.63
ATMQ13315 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
ATMQ13315 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
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