Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms