Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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TRAF1Q13077 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TRAF1Q13077 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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