Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HMGXB3Q12766 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
HMGXB3Q12766 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
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