Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CHRNEQ04844 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms