Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
ERFP50548 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
ERFP50548 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
ERFP50548 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.6 ms