Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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TTPAP49638 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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TTPAP49638 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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