Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
LTBRP36941 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
LTBRP36941 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LTBRP36941 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LTBRP36941 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
LTBRP36941 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
LTBRP36941 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
LTBRP36941 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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