Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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USP18Q9UMW8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
USP18Q9UMW8 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
USP18Q9UMW8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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