Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ARHGEF3Q9NR81 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ARHGEF3Q9NR81 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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