Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
VN1R3Q9BXE9 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
VN1R3Q9BXE9 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms