Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RBM42Q9BTD8 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RBM42Q9BTD8 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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