Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
ZNF548Q8NEK5 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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