Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
ANKRD40Q6AI12 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
ANKRD40Q6AI12 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms