Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CDO1Q16878 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms