Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
HIST2H2ACQ16777 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HIST2H2ACQ16777 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms