Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SLC18A3Q16572 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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