Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.23□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYCP1Q15431 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SYCP1Q15431 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
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SYCP1Q15431 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SYCP1Q15431 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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SYCP1Q15431 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SYCP1Q15431 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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