Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
SHPRHQ149N8 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AL953862.1-201ENST00000423016 168 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
SHPRHQ149N8 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.58
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