Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PDE6HQ13956 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PDE6HQ13956 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms