Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CACNA1SQ13698 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms