Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
SKP2Q13309 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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SKP2Q13309 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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SKP2Q13309 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
SKP2Q13309 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
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