Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CHAF1AQ13111 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHAF1AQ13111 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms