Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
CNTN1Q12860 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CNTN1Q12860 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms