Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
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PTPRBP23467 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPRBP23467 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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