Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AP000770.2-201ENST00000623694 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VAX2Q9UIW0 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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