Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
USP35Q9P2H5 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
USP35Q9P2H5 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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