Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.17
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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CHCHD4Q8N4Q1 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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