Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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USP43Q70EL4 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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USP43Q70EL4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
USP43Q70EL4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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USP43Q70EL4 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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USP43Q70EL4 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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