Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-1305P-201ENST00000364353 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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GEN1Q17RS7 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GEN1Q17RS7 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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