Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
HERC1Q15751 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
HERC1Q15751 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
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