Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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PTPRKQ15262 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRKQ15262 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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PTPRKQ15262 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRKQ15262 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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