Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
KARSQ15046 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
KARSQ15046 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
KARSQ15046 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
KARSQ15046 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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