Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GPNMBQ14956 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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GPNMBQ14956 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GPNMBQ14956 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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