Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MICF-203ENST00000432679 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN5AQ14524 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN5AQ14524 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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