Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CAPRIN1Q14444 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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