Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
CACNA1CQ13936 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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