Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
CUL3Q13618 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms